MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 8495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018078	GCGCT	2	10	847314	847323	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1502	NC_018078	CAT	2	6	847325	847330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_018078	ACA	2	6	847343	847348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_018078	CGA	2	6	849173	849178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_018078	GCC	2	6	851344	851349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_018078	GAC	2	6	851533	851538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_018078	TAC	2	6	851829	851834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_018078	GAC	2	6	851868	851873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_018078	CGCT	2	8	851874	851881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_018078	AGG	2	6	851911	851916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_018078	GC	3	6	852689	852694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_018078	ACT	2	6	852754	852759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_018078	ATCGG	2	10	853569	853578	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1514	NC_018078	GAG	2	6	853585	853590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_018078	C	8	8	855457	855464	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1516	NC_018078	ACG	2	6	860131	860136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_018078	GTC	3	9	860139	860147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_018078	GCA	2	6	860171	860176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_018078	GC	3	6	860177	860182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_018078	CAGA	2	8	860223	860230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_018078	GTC	2	6	860289	860294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_018078	GTC	2	6	860298	860303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_018078	GTC	2	6	860313	860318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_018078	AGC	3	9	860339	860347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_018078	GTG	2	6	860369	860374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_018078	CTGG	2	8	860416	860423	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_018078	TCC	2	6	860444	860449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_018078	GTG	2	6	860503	860508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_018078	GGC	2	6	860509	860514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_018078	TGG	3	9	860541	860549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_018078	CAG	2	6	860632	860637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_018078	GCC	3	9	860661	860669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_018078	TCA	2	6	860700	860705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_018078	TCGA	2	8	860708	860715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_018078	CGC	2	6	860716	860721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_018078	CGG	2	6	860728	860733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_018078	GCA	2	6	860763	860768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_018078	GC	3	6	860781	860786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_018078	CGGT	2	8	860798	860805	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_018078	CATC	2	8	860835	860842	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_018078	CCG	2	6	860950	860955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_018078	GTC	2	6	861004	861009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_018078	GCA	2	6	861114	861119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_018078	CGT	2	6	861120	861125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_018078	CGA	2	6	861191	861196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_018078	TACGGG	2	12	861200	861211	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1547	NC_018078	AGTCGT	2	12	861222	861233	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1548	NC_018078	AGG	2	6	861942	861947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_018078	CGCGA	2	10	861988	861997	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1550	NC_018078	GAT	2	6	862083	862088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_018078	CCGGCG	2	12	864363	864374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_018078	GCG	2	6	864451	864456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_018078	CCAA	2	8	868618	868625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_018078	CGC	2	6	868638	868643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_018078	GCA	2	6	869602	869607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_018078	ACCGGG	2	12	871084	871095	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_018078	ACT	2	6	871168	871173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_018078	CGT	2	6	874521	874526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_018078	GCG	2	6	874527	874532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_018078	CG	3	6	879668	879673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_018078	GCCGA	2	10	879721	879730	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1562	NC_018078	CTG	2	6	879771	879776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_018078	GCC	2	6	883640	883645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_018078	GGC	2	6	883681	883686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_018078	GCG	2	6	883701	883706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_018078	GAG	3	9	883716	883724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_018078	CGG	2	6	885258	885263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_018078	CGT	2	6	885267	885272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_018078	CAC	2	6	887878	887883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_018078	GCGT	2	8	887889	887896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_018078	AGC	2	6	887904	887909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_018078	GAA	2	6	887911	887916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_018078	CCG	2	6	888288	888293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_018078	ACC	2	6	888297	888302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_018078	C	6	6	888308	888313	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1576	NC_018078	GCG	2	6	888323	888328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_018078	CGG	3	9	888329	888337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_018078	TCG	2	6	889857	889862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_018078	CG	3	6	889882	889887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_018078	CCA	2	6	889920	889925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_018078	TG	4	8	889985	889992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_018078	GGTG	2	8	889999	890006	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_018078	GGT	2	6	890033	890038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_018078	CCGG	2	8	890132	890139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_018078	CAC	2	6	895490	895495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_018078	GCCC	2	8	895506	895513	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1587	NC_018078	CTAG	2	8	895611	895618	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_018078	CGG	2	6	898614	898619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_018078	CGC	2	6	898620	898625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_018078	CAAT	2	8	898650	898657	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_018078	GTT	2	6	901357	901362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_018078	AGTTC	2	10	901380	901389	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1593	NC_018078	CAG	2	6	901424	901429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_018078	GCC	2	6	901439	901444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_018078	TGGA	2	8	901448	901455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_018078	GT	3	6	901898	901903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_018078	CGG	2	6	901942	901947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_018078	ACGC	2	8	903546	903553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_018078	ACGCC	2	10	904698	904707	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1600	NC_018078	G	6	6	904733	904738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_018078	GTG	2	6	904746	904751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_018078	GGC	2	6	904977	904982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_018078	GCC	2	6	905027	905032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_018078	GGC	2	6	905046	905051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_018078	CCG	2	6	905056	905061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_018078	TGT	2	6	907152	907157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_018078	TCG	2	6	907869	907874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_018078	GAA	2	6	907946	907951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_018078	CAC	2	6	907955	907960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_018078	GCGGCC	2	12	907975	907986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_018078	CGG	2	6	909272	909277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_018078	GCT	2	6	909304	909309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_018078	TGC	2	6	909315	909320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_018078	CAG	2	6	909340	909345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_018078	ACAGCA	2	12	909348	909359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_018078	GGC	2	6	909371	909376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_018078	GGC	2	6	910732	910737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_018078	ACG	2	6	910803	910808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_018078	C	7	7	912542	912548	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1620	NC_018078	AAG	2	6	912549	912554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_018078	CGT	2	6	914088	914093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_018078	GCA	2	6	916232	916237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_018078	GCA	2	6	916263	916268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_018078	GC	3	6	917500	917505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_018078	TCG	2	6	917512	917517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_018078	CCT	2	6	917540	917545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_018078	GC	3	6	917558	917563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_018078	TCG	2	6	917570	917575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_018078	AT	3	6	918635	918640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_018078	TC	3	6	918646	918651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_018078	CG	3	6	918673	918678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1633	NC_018078	CGG	2	6	918717	918722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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